Veškeré akce jsou provedeny prakticky okamžitě, velmi rychlá odezva, malá velikost (v základní instalaci asi 40MB). Malá velikost a velká rychlost používaných programů.

MOS dokáže dynamicky využít volnou paměť k vytvoření disku. Tento je vlastně paměť, do které lze ukládat data jako na kterýkoliv jiný disk, nicméně práce s ním je rychlá a přehledná. Výborná věc pro instalování programů na zkoušku a souborů, které už v budoucnu nebudou potřeba, neboť Ram Disk se samozřejmě maže resetem.

MorphOS umožňuje naprosté většině spuštěných programů vytvořit si svoji vlastní obrazovku. Takový program potom neběží pouze v oknu, ale má pro sebe celý prostor monitoru. Obrazovek může být až 256, každá je nezávislá na ostatních, může mít svoje vlastní rozlišení a barevnou hloubku. Přepínání mezi nimi je možné okamžitě bez jakékoliv prodlevy.

Preemtivní multitasking, který počítač nijak nezpomaluje.

Veškeré instalované programy se vlastně prakticky neinstalují, ale pouze kopírují. V případě potřeby se potom mohou bez problémů smazat. Neexistují žádné registry, neexistuje žádné zpomalování systému v přímé úměře na množství používaných programů. Je možné "nainstalovat" a "odinstalovat" desetitisíce programů, aniž by se běh OS jakkoli zpomaloval a nebo měnil.

MorphOS má jasně danou adresářovou strukturu. Každý soubor, který v systému je, lze snadno a logicky dohledat, nic se v systému neztrácí do, pro uživatele skrytých, míst (registry a podobně).

V jakékoli chvíli lze MorphOS vypnout a restartovat a systém bude vždy (a nebo skoro vždy :) opět zpětně bez problémů zaveden. Žádný scandisk a podobně není nutný. I kdyby se stalo něco opravdu hrozného (shoří harddisk :), není problém dělat si bootovací zálohu na CD. Toto CD je pak klidně možné přímo na Pegasosu spustit a pracuje se dál ;) Z toho plyne i snadná oprava případných problémů z takto vytvořeného CD, které může obsahovat i opravné utitlitky a podobně.

Je možné softwarově zamknout disk a od té chvíle bude možné zapisovat pouze pokud se disk vypne. Nic se neukládá bez vědomí uživatele. Softwarový zámek je možný udělat i s heslem a potom je to i dobrá ochrana proti virům a jiným nechtěným programům.

Do systému je možné přidávat programy, které zlepšují jeho užitné vlastnosti takzvané commodities. Jejich správa je centrálně zajištěna a lze je odebírat i přidávat i za chodu systému. Každý si může svůj systém upravit podle svých potřeb a požadavků.

Rychlá JIT emulace procesoru Motorola 68xxx, umožňující běh některých systémových programů určených původně pro počítač Amiga a operační systém Amiga OS. Emulace běží v pozadí a pro běžného uživatele je naprosto skrytá a nijak ji nepozná. Prostě jen spustí program a o vše ostatní se postará MorphOS. Rychlost takto emulovaných programů je fantastická a vyrovná se i nativnim programům určeným přímo pro PPC. Tím se pro Pegasos zpřístupňuje dalších několik set až tisíc aplikací.